Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms