Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms