Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klc3Q91W40 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms