Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg8Q8VE18 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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