Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc39cQ8VE09 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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