Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms