Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hecw1Q8K4P8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms