Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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