Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms