Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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SbsnQ8CIT9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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SbsnQ8CIT9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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SbsnQ8CIT9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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