Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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