Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CC96 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8CC96 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8CC96 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8CC96 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms