Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms