Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms