Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms