Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms