Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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