Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sys1Q78S06 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sys1Q78S06 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sys1Q78S06 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sys1Q78S06 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sys1Q78S06 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms