Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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