Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms