Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc88cQ6VGS5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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