Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms