Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Ccdc18Q640L5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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