Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms