Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhQ62361 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhQ62361 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms