Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn9aQ62205 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn9aQ62205 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn9aQ62205 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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