Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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