Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms