Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Grik1Q60934 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Grik1Q60934 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Grik1Q60934 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik1Q60934 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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