Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfsf15Q5UBV8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms