Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Trim38Q5SZ99 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trim38Q5SZ99 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trim38Q5SZ99 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trim38Q5SZ99 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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