Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdp2Q504M2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms