Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc185Q3V118 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms