Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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