Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ankrd53Q3V0J4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms