Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms