Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm6899Q3USS0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm6899Q3USS0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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