Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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