Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms