Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms