Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U595 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U595 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U595 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U595 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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