Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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