Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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