Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms