Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms