Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spatc1Q148B6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms