Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms