Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms