Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms