Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms